目前全世界报道寄生于鸡肠道的球虫共有9种，即柔嫩、毒害、巨型、堆型等，其中柔嫩致病力最强，危害最大，因寄生于盲肠故又名盲肠球虫；毒害、巨型和堆型等常寄生于小肠，对十二指肠和空肠造成不同的病例损伤，尤其是毒害（又称小肠球虫）致病力和危害仅次于盲肠球虫；和缓、早熟、哈氏和变位等致病力均较弱，前三者寄生于十二指肠和前1/3段空肠，后者寄生于回肠和空肠后1/3段；布氏寄生于回肠、直肠以及盲肠近端区，致病力较强，可引起肠道凝固性坏死和黏液性出血性肠炎。
的雏鸡，主要由柔嫩和毒害引发。表现精神沉郁，食欲减退或废绝，羽毛蓬松，排水样稀便甚至血便；后期鸡冠、肉髯苍白，消瘦，多数鸡于发病3天~5天内衰竭死亡。剖检可见两侧盲肠明显增粗呈暗红色，肠管内充满血液或血块，或混有血液的干酪样物；肠壁增厚，黏膜上有点状出血，严重时黏膜脱落，有分散的溃烂灶；小肠高度肿胀、充血、出血、坏死，在肠黏膜的病变处可见到许多红白相间的斑点。
2.慢性型和亚急性型多见于4月龄~6月龄的鸡或成年鸡，病程稍长，主要由巨型、堆型、布氏等引发，症状无急性型明显，主要表现为贫血，食欲减少，进行性消瘦，生长缓慢，羽毛松乱，产蛋量下降，呈间歇性下痢，死亡率较低。剖检可见小肠肠壁增厚，黏膜水肿、充血、出血，可见灰白色坏色点；肠内容物呈褐色或红褐色黏稠液体，有时混有很小的血凝块，严重时病变可扩展到整个小肠。
强化饲养管理，控制饲养密度，保持鸡舍清洁、卫生干燥，坚持“全进全出”的饲养制度。一般消毒药很难杀死球虫卵囊，对空鸡舍最好选用火焰消毒法，以彻底消灭球虫卵囊。
用于治疗和预防球虫病的药物有两大类：化学合成抗球虫药和聚醚类抗生素，前者常见有地克珠利、妥曲珠利、尼卡巴嗪、氨丙啉、常山酮、磺胺类（SQ、ESb3等）以及增效剂乙氧酰胺苯甲酯等，后者常见有盐霉素、马杜拉霉素、海南霉素等。
结合球虫生活史和药物作用峰期，合理选用不同的药物对球虫进行防治。一般情况下，球虫感染前3天为无性生殖阶段，待出现血便时已经进入有性生殖阶段。作用峰期在球虫感染后第1天~2天的药物，其抗球虫作用较弱，多用于预防和早期治疗用，而作用峰期在感染后的第3天~4天的药物，其抗球虫作用较强，多用于治疗应用。
推荐方案：雏鸡7天~10天，用新球宝（兑水500升/100毫升）/丰强球救（兑水升/100毫升），饮水连用5天，对球虫病有良好的预防作用。
目前可供使用的疫苗有强毒苗和弱毒苗两种。虽然球虫疫苗的使用不很普遍，但是实践证明其效果良好。据报道，国内研制成功晚熟系球虫苗Einerirac以及早、中、晚熟系联合球虫苗Einerirac.plus，在1日龄~3日龄采用拌料、混饮、滴口、喷雾等方式接种，均具有良好效果，其中以滴口法最佳，喷雾法应激最小。
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